Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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