Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ric1Q69ZJ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ric1Q69ZJ7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms