Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brsk2Q69Z98 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms