Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pkp4Q68FH0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp4Q68FH0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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