Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms