Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8eQ66JT1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms