Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja3Q64448 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja3Q64448 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms