Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Irf4Q64287 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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