Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sf1Q64213 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf1Q64213 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms