Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc1Q64028 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms