Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Defa17Q64016 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Defa17Q64016 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa17Q64016 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Defa17Q64016 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Defa17Q64016 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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