Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col4a5Q63ZW6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a5Q63ZW6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms