Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf260Q62513 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms