Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lcn3Q62471 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lcn3Q62471 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lcn3Q62471 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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