Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga3Q62470 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga3Q62470 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms