Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms