Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ndufa4Q62425 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms