Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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AtmQ62388 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtmQ62388 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms