Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SypQ62277 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SypQ62277 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SypQ62277 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SypQ62277 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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