Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six1Q62231 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Six1Q62231 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six1Q62231 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms