Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttf1Q62187 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms