Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms