Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhocQ62159 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhocQ62159 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms