Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms