Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phox2aQ62066 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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