Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga6Q61739 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms