Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ecm1Q61508 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ecm1Q61508 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms