Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms