Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms