Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms