Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms