Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms