Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JrkQ60976 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JrkQ60976 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms