Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ncor1Q60974 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncor1Q60974 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms