Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms