Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms