Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3Q60803 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms