Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms