Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2f1Q60632 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2f1Q60632 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms