Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tdrd5Q5VCS6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tdrd5Q5VCS6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tdrd5Q5VCS6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms