Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms