Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme4Q5SSW2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms