Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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