Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms