Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3kQ5GIG6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnni3kQ5GIG6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms