Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms