Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
WhammQ571B6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
WhammQ571B6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms