Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBD9

Gzf1, GDNF-inducible zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gzf1Q4VBD9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gzf1Q4VBD9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Gzf1Q4VBD9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gzf1Q4VBD9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gzf1Q4VBD9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms