Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms