Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms